红旗农场的前身是1958年4月在克孜勒苏柯尔克孜自治州阿图什县松他克乡成立的红旗一场,归自治区农垦局管理,为正县级单位。1970年2月至1976年2月文化大革命期间红旗一场改名为“五七”农场,实行军管制。文革结束后,“五七”农场撤销,1979年由阿图什县移交至克州农垦局管辖。1984年4月划入新疆生产建设兵团农三师建制,为正营级单位,伽师总场托管。2018年4月脱离托管,升级为正团级单位。
农场位于阿图什市境内的布谷孜河下游冲积平原上,东经76°11"—76°58",北纬39°45"—40°40",海拔1200米—1700米之间。位于克州阿图什市以东15公里,距喀什市45公里、喀什机场39公里、吐尔尕特口岸70公里、伊尔克什坦口岸100公里,距图木舒克市290公里。东南方向与格达良乡接壤,西南方向与松他克乡为邻,西至阿湖乡,北达哈拉峻乡。314国道、219国道、吐和高速、南疆铁路贯穿场部。以农场场部为圆心,20公里为半径,圈内有阿图什市、格达良乡、阿湖乡、哈拉峻乡、松他克乡、阿扎克乡,伽师九乡,人口38万余人。
农场为典型的大陆性干旱气候,春季多风,夏季炎热少雨,昼夜温差大,冬夏寒暑分明,年平均气温12.97℃,年平均无霜期226天,年平均降水量47.7mm。